MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 32006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020540	T	6	6	251	256	0 %	100 %	0 %	0 %	470200146
2	NC_020540	T	6	6	310	315	0 %	100 %	0 %	0 %	470200146
3	NC_020540	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200146
4	NC_020540	A	7	7	395	401	100 %	0 %	0 %	0 %	470200146
5	NC_020540	CTG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200146
6	NC_020540	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200146
7	NC_020540	AGC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200146
8	NC_020540	TGC	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200146
9	NC_020540	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200146
10	NC_020540	AT	3	6	768	773	50 %	50 %	0 %	0 %	470200146
11	NC_020540	TTA	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200146
12	NC_020540	GAAA	2	8	837	844	75 %	0 %	25 %	0 %	470200146
13	NC_020540	TGA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200146
14	NC_020540	A	7	7	895	901	100 %	0 %	0 %	0 %	470200146
15	NC_020540	CT	3	6	904	909	0 %	50 %	0 %	50 %	470200146
16	NC_020540	AAG	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200146
17	NC_020540	ATA	3	9	950	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200146
18	NC_020540	ACAA	2	8	959	966	75 %	0 %	0 %	25 %	470200146
19	NC_020540	ATC	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200146
20	NC_020540	AGA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200146
21	NC_020540	CCT	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470200146
22	NC_020540	CAAA	2	8	1224	1231	75 %	0 %	0 %	25 %	470200146
23	NC_020540	TGC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200146
24	NC_020540	GAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200146
25	NC_020540	CTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200146
26	NC_020540	TGG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200146
27	NC_020540	TAA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200146
28	NC_020540	A	6	6	1569	1574	100 %	0 %	0 %	0 %	470200146
29	NC_020540	ATT	2	6	1768	1773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200147
30	NC_020540	TCA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200147
31	NC_020540	GTAA	2	8	1919	1926	50 %	25 %	25 %	0 %	470200147
32	NC_020540	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200147
33	NC_020540	T	7	7	1981	1987	0 %	100 %	0 %	0 %	470200147
34	NC_020540	ATT	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200147
35	NC_020540	AAC	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200147
36	NC_020540	GTT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200147
37	NC_020540	AAG	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200147
38	NC_020540	ATT	2	6	2161	2166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200147
39	NC_020540	TAT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200147
40	NC_020540	GTC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200147
41	NC_020540	GACT	2	8	2278	2285	25 %	25 %	25 %	25 %	470200147
42	NC_020540	CAG	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200147
43	NC_020540	GA	3	6	2365	2370	50 %	0 %	50 %	0 %	470200147
44	NC_020540	CAG	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200147
45	NC_020540	GAT	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200147
46	NC_020540	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200147
47	NC_020540	GTT	2	6	2531	2536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200147
48	NC_020540	CTT	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200147
49	NC_020540	GGTAA	2	10	2666	2675	40 %	20 %	40 %	0 %	470200147
50	NC_020540	AGTC	2	8	2696	2703	25 %	25 %	25 %	25 %	470200147
51	NC_020540	GAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200147
52	NC_020540	AATT	2	8	2850	2857	50 %	50 %	0 %	0 %	470200147
53	NC_020540	TAAG	2	8	2876	2883	50 %	25 %	25 %	0 %	470200147
54	NC_020540	TGAAA	2	10	2976	2985	60 %	20 %	20 %	0 %	470200148
55	NC_020540	A	6	6	2983	2988	100 %	0 %	0 %	0 %	470200148
56	NC_020540	ATG	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200148
57	NC_020540	A	7	7	3129	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	470200148
58	NC_020540	CAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200149
59	NC_020540	GCT	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200149
60	NC_020540	TGGTA	2	10	3602	3611	20 %	40 %	40 %	0 %	470200149
61	NC_020540	A	7	7	3660	3666	100 %	0 %	0 %	0 %	470200149
62	NC_020540	AAAT	2	8	3740	3747	75 %	25 %	0 %	0 %	470200149
63	NC_020540	TGA	3	9	3800	3808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200149
64	NC_020540	TCAA	2	8	3906	3913	50 %	25 %	0 %	25 %	470200149
65	NC_020540	A	6	6	3934	3939	100 %	0 %	0 %	0 %	470200149
66	NC_020540	AGA	2	6	4046	4051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200149
67	NC_020540	GTT	2	6	4062	4067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200149
68	NC_020540	AAC	2	6	4085	4090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200149
69	NC_020540	CAAA	2	8	4160	4167	75 %	0 %	0 %	25 %	470200149
70	NC_020540	AGT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200149
71	NC_020540	AGA	3	9	4223	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200149
72	NC_020540	AGA	2	6	4259	4264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200149
73	NC_020540	AGC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200149
74	NC_020540	ATC	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200149
75	NC_020540	CAG	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200149
76	NC_020540	GCT	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200149
77	NC_020540	TAT	2	6	4421	4426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200149
78	NC_020540	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200149
79	NC_020540	AAG	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200149
80	NC_020540	GAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200149
81	NC_020540	TGT	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200149
82	NC_020540	CAT	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200149
83	NC_020540	GAA	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414887
84	NC_020540	TTG	2	6	4678	4683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523414887
85	NC_020540	A	6	6	4711	4716	100 %	0 %	0 %	0 %	523414887
86	NC_020540	GAT	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414887
87	NC_020540	TTA	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414887
88	NC_020540	CTA	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414887
89	NC_020540	AAT	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414887
90	NC_020540	CTA	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414887
91	NC_020540	ATG	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414887
92	NC_020540	TTACGT	2	12	4968	4979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	523414887
93	NC_020540	CAG	2	6	4990	4995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414887
94	NC_020540	GAC	2	6	5071	5076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414887
95	NC_020540	TTA	2	6	5095	5100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414887
96	NC_020540	ATA	2	6	5131	5136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414887
97	NC_020540	TTTA	2	8	5182	5189	25 %	75 %	0 %	0 %	523414887
98	NC_020540	A	6	6	5206	5211	100 %	0 %	0 %	0 %	523414887
99	NC_020540	ATT	2	6	5251	5256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414888
100	NC_020540	ACC	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523414888
101	NC_020540	GAT	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
102	NC_020540	A	9	9	5379	5387	100 %	0 %	0 %	0 %	523414888
103	NC_020540	TGA	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
104	NC_020540	T	6	6	5474	5479	0 %	100 %	0 %	0 %	523414888
105	NC_020540	TGA	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
106	NC_020540	TTA	2	6	5736	5741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414888
107	NC_020540	T	6	6	5819	5824	0 %	100 %	0 %	0 %	523414888
108	NC_020540	GAT	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
109	NC_020540	AAC	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523414888
110	NC_020540	TTA	2	6	5898	5903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414888
111	NC_020540	GAT	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
112	NC_020540	A	6	6	5993	5998	100 %	0 %	0 %	0 %	523414888
113	NC_020540	AGA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414888
114	NC_020540	A	6	6	6028	6033	100 %	0 %	0 %	0 %	523414888
115	NC_020540	ATT	2	6	6070	6075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414888
116	NC_020540	ATT	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414888
117	NC_020540	T	6	6	6128	6133	0 %	100 %	0 %	0 %	523414888
118	NC_020540	GAT	2	6	6134	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
119	NC_020540	GATTT	2	10	6168	6177	20 %	60 %	20 %	0 %	523414888
120	NC_020540	AGA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414888
121	NC_020540	ACT	2	6	6237	6242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414888
122	NC_020540	CTT	2	6	6286	6291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523414888
123	NC_020540	T	6	6	6368	6373	0 %	100 %	0 %	0 %	523414888
124	NC_020540	TTGA	2	8	6389	6396	25 %	50 %	25 %	0 %	523414888
125	NC_020540	A	7	7	6414	6420	100 %	0 %	0 %	0 %	523414888
126	NC_020540	AAC	2	6	6424	6429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523414888
127	NC_020540	ACGA	2	8	6462	6469	50 %	0 %	25 %	25 %	523414888
128	NC_020540	CCTT	2	8	6502	6509	0 %	50 %	0 %	50 %	523414888
129	NC_020540	AGTG	2	8	6511	6518	25 %	25 %	50 %	0 %	523414888
130	NC_020540	TGA	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
131	NC_020540	ACG	2	6	6640	6645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414888
132	NC_020540	GATTCA	2	12	6763	6774	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	523414888
133	NC_020540	TAG	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
134	NC_020540	CTG	2	6	6870	6875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414888
135	NC_020540	TAA	2	6	6895	6900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414888
136	NC_020540	ATG	2	6	6906	6911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414888
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267	NC_020540	TTTA	2	8	12065	12072	25 %	75 %	0 %	0 %	523414890
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273	NC_020540	A	7	7	12338	12344	100 %	0 %	0 %	0 %	470200156
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